A geração de dados

Para o patosistema Musa-Mycosphaerella foi realizada a infecção dos patógenos Mycosphaerella musicola e Mycosphaerella fijiensis (México). As Plantas infectadas foram Calcuta 4 – ITC acesso ITC0249 e Grand Naine – ITC acesso ITC0654. O experimento apresentou a seguinte cinética da infecção: DAI (Dia após a infecção)3, 6 e 9 baseados em exames histopatológicos do processo de infecção. As estratégias de seqüenciamento foram utilizar primeiramente as bibliotecas de cDNA enriquecidas e submetidas ao sequenciamento 454 Roche GS FLX tecnologia Titanium, para a descoberta de genes, expressão diferencial e desenvolvimento de marcadores. Em seguida, a tecnologia Illumina foi aplicada mRNAseq/HiSeq para identificação de genes diferencialmente expressos e desenvolvimento de marcadores.

M. acuminata Calcutta 4 (accession ITC0654) M. acuminata Cavendish Grande naine (accession ITC0249)
C4NI Library C4I Library CAVNI Library CAVI Library
Non-inoculated control Inoculated Non-inoculated control Inoculated
Number of plants (3 DAI) 3 3 3 3
Number of plants (6 DAI) 3 3 3 3
Number of plants (9 DAI) 3 3 3 3
TOTAL 9 9 9 9

Resumo do projeto

O presente projeto apresenta a proposta de estudos das interações planta-patógeno em dois patosistemas: Sigatoka negra em banana e Fusariose em trigo. O projeto integra atividades de análise de dados gerados pelas tecnologias de Nova Geração de Sequenciamento e a busca de fatores moleculares que causam essas doenças. E igualmente pesquisar a expressão diferencial em plantas resistentes e sucetíveis.